Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Krt27Q9Z320 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt27Q9Z320 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms