Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CcniQ9Z2V9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcniQ9Z2V9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms