Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Robo3Q9Z2I4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms