Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms