Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms