Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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