Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn7Q9Z261 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms