Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms