Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs4Q9Z1T2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs4Q9Z1T2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms