Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms