Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms