Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms