Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn9Q9Z0S7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn9Q9Z0S7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn9Q9Z0S7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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