Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srd5a3Q9WUP4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srd5a3Q9WUP4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms