Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms