Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms