Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms