Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggps1Q9WTN0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms