Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp6ap1Q9R1Q9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms