Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit2Q9R1B9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms