Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms