Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NrkQ9R0G8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms