Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plod1Q9R0E2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Plod1Q9R0E2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms