Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms