Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms