Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms