Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod2Q9R0B9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod2Q9R0B9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms