Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BcamQ9R069 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BcamQ9R069 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms