Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms