Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtsjQ9R014 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms