Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3Q9QZS0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Col4a3Q9QZS0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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