Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Usp21Q9QZL6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Usp21Q9QZL6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Usp21Q9QZL6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Usp21Q9QZL6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Usp21Q9QZL6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Usp21Q9QZL6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Usp21Q9QZL6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp21Q9QZL6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Usp21Q9QZL6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp21Q9QZL6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Usp21Q9QZL6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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