Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms