Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms