Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms