Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms