Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Kcnip3Q9QXT8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Kcnip3Q9QXT8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Kcnip3Q9QXT8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Kcnip3Q9QXT8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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