Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms