Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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