Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms