Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk3Q9QUN9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms