Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms