Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg4Q9JM99 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms