Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpc4apQ9JLV2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms