Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms