Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms