Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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FancaQ9JL70 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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FancaQ9JL70 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FancaQ9JL70 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms