Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gde1Q9JL56 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gde1Q9JL56 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gde1Q9JL56 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gde1Q9JL56 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms