Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms