Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms